甲公司于2001年2月26日向全国12家A设备供货商发出关于以招标方式购买A设备的信息，并对A设备的基本性质、质量、技术标准和供货时间作了原则性要求。乙公司等12家供货商于4月15日参加了甲公司购买A设备的招标会，并于当日投标。乙公司投标书的主要内容如下：（1）向甲公司提供A设备3台，每台价格64万元。（2）所提供设备的产地、规格、质量、性能及主要技术参数。（3）乙公司于2001年6月10日前将3台A设备运到甲公司所在地。（4）甲公司开箱验货后认为符合要求，则当即一次性支付80%的货款。（5）剩余20%的货款在甲方试用设备期满后，于6月25日一次结清。（6）任何一方违约均按总标的15%支付违约金。（7）若乙公司中标后因未能按期供货而给甲方造成损失，每日按总标的5％支付赔偿金。4月22日乙公司收到中标通知，甲公司希望乙公司如期履行标书约定的权利和义务。6月10日乙公司将2台A设备运往甲公司，甲公司按实收设备价格的80%开出银行汇票支付货款，乙公司提出应按3台设备价格的80%支付，甲方予以拒绝。6月13日乙公司将剩余1台A设备运往甲公司，并要求甲公司一次结清所有余款，并由甲公司负担设备的运费。甲公司认为乙公司关于付清全部设备款项的要求不合理，至于运费问题因事先标书中未说明由哪一方负担，可以协商。全部设备试用合格后，甲公司于6月25日补付3台设备20%的余款时，要求乙公司同时向甲公司支付因延期交货的违约金。乙公司认为甲公司属无理要求，乙公司虽有一台设备延期交货，但未给甲公司造成任何损失。
请问：
（1）合同订立过程中，要约和承诺两个阶段分别在什么时间生效，要约人、承诺人分别是哪一方说明理由。
（2）6月10日甲方拒绝乙方的要求是否合理说明理由。
（3）甲方要求乙方支付违约金的理由是否成立，为什么
（4）如双方不能达成补充协议，运费应由哪一方负担，为什么