配体与受体相互作用是分子识别的过程，主要包括氢键作用、疏水作用、范德华作用、静电作用等。

判断题依据配体与受体作用的“锁-钥原理”（lock and key principle），可以模拟小分子配体与受体生物大分子相互作用。

单项选择题下列哪一项不属于glide分子对接操作步骤（）。

A.蛋白准备
B.配体准备
C.结构分析
D.分子对接

单项选择题下列哪种方式不能判断体系是否达到平衡（）。

A.看能量是否收敛
B.看系统压强，密度等等是否收敛。
C.看系统的RMSD值是否达到能接受的范围
D.看体系能量是否最小化

单项选择题分子动力学的一般步骤为（） ①初始化 ②平衡 ③能量优化 ④数据产出

A.①②③④
B.①③②④
C.②①③④
D.③①②④

单项选择题采用分子力学力场，假定体系中任意原子运动符合经典牛顿力学。当（）和（）给定后，积分后可得各原子的运动轨迹。

A.速度、方向
B.初始坐标、角度
C.初始坐标、速度
D.初始坐标、方向

单项选择题分子动力学是一套分子模拟方法，该方法主要是依靠（）来模拟分子体系的运动。

A.量子力学
B.牛顿力学
C.动能和势能
D.原子能量

问答题根据已有的知识，论述从片段到先导化合物的设计方法并解释各类方法的原理。

问答题论述下列化合物的设计原理和特点：

问答题论述先导化合物发现的预测方法。

问答题简述基于类药性的药物设计策略。

问答题简述钙离子成为胞内信使的基础。

问答题在前药设计时一般应考虑哪些因素？

问答题试述蛋白质在信号转导功能中的变化。

问答题引起药物毒性的因素有哪些？

问答题可以从哪些方面考虑进行专利边缘的创新药物设计？