某有限责任公司成立以来，经济效益一直很好，但是，该公司在纳税问题上，却经常拖欠税款。2009年3月，税务机关在依法进行的税务检查过程中，发现该公司有逃避纳税义务的行为，为了保证该公司2009年上半年的税款能够按时缴纳，税务机关责令该公司在5月份缴纳2009年上半年税款。在此期间内，税务机关发现该公司有明显的转移财产的行为。税务机关首先通知该公司提供纳税担保，该公司一直置之不理。无奈之下，税务机关扣押了该公司的一批价值相当于应纳税款的货物。
要求：
根据以上情况，回答下列问题： 税务机关扣押货物后，应当如何处理本案请说明理由。