磁共振波谱分析是利用MR中的化学位移来测定分子组成及空间构型的检测方法，可检测细胞内许多与生化代谢有关的化合物，提供细胞内化学代谢的信息。把兴趣部位的MRS灰阶化，即成为磁共振波谱成像（MRSI）。1H｜MRS主要用于观察脑的代谢情况；31P｜MRS主要用于观察心肌和前列腺的代谢情况。
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