核桃根系发达，为深根性树种。1-2年生实生苗垂直根生长很快，地上生长慢。第三年水平根生长加快，侧根数量急增，地上部生长也加快。第四年地上部生长比根系快，为了促进地上部生长，常于幼苗期切断主根。核桃根系垂直分布深，水平扩展范围大，在不受损伤情况下，百年以上的老树根系很少出现腐朽现象。
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