细菌广泛存在于自然界中，土壤、空气、水、有机物都带有大量的细菌，条件适宜时从污染到形成菌落仅需几小时。芽孢杆菌在环境不利时，母细胞可形成一休眠芽孢，这种芽孢极耐高温。细菌主要靠空气或食用菌原材料传播，培养基灭菌不彻底，接种时操作不当，菌种本身带菌，培养料含水太高，都会导致污染的发生。
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