单核的游动孢子内细胞核被一个大的核帽完全包住。在孢子内含有一个线粒体，线粒体内侧紧靠细胞核，线粒体的外侧连有类脂体和微体。线粒体—微体—类脂体外围由被称为背膜的双膜系统包围而构成侧泡复合体，侧泡复合体可分解类脂从而释放能量供鞭毛运动。
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